对于马芳的上疏，朱载坖还是非常重视的，朱载坖在和俺答封贡的时候就很清楚，大明和俺答的所谓和平，只不过是双方的权宜之计罢了，现在俺答虽然不敢在宣大三镇搞事情了，但是俺答借着追击瓦剌余孽的口号，在陕西三边搞事情。
马芳在奏疏中陈奏：“东虏西来，以迎佛为号，以仇瓦剌为名，以抢番为欲，而侵牧我内地，切扰我兵民者也。”马芳认为，俺答的目的是占领西海，使之成为右翼蒙古的牧场，同时由于白莲教被抛弃，俺答需要找到新的军师和信仰来团结蒙古诸部，俺答现在找到的是藏传佛教。
马芳认为，大明的边防策略应该是阻隔蒙古人与甘青藏族部落的接触，以隔绝羌胡作为治理西番诸卫的战略方针，一旦俺答真的将势力侵入青海，那么大明的陕甘诸镇有极为危险了。
马芳在奏疏中颇为忧虑的说道：“一旦俺答西向，不独北面为虏，而四面皆虏矣。且仰华创建于西海，则北虏假道于甘、凉，饮马黑河动以岁计，鸣笳洪水辄至万余。扰我耕牧，梗我行商，不独四面皆虏，而腹心亦虏矣！”
对于马芳的奏疏，朱载坖是非常重视的，虽然现在大明还无力经略西域，但是朱载坖也也绝不可能放弃青海等处，朱载坖对重臣们说道：“丰州伯所奏，朕以为极为重要，隔绝羌胡乃是我大明的一向之策，虽然现在和俺答封贡，但决不能放任俺答。”
杨博有些担忧的说道：“陛下，自封贡以来，俺答颇为恭顺，边警日熄，若如丰州伯之言，一旦封贡破裂，九边又要烽烟四起，陛下深思之！”
新上任的户部尚书刘体乾也说道：“陛下，太仓刚刚缓过来，上没有多少储积，还请陛下忍耐一时。”
朱载坖问道：“高师傅怎么看？”
高拱这才说道：“陛下，臣在想，大明不愿九边重燃战火，俺答就愿意与大明撕破脸吗？”
朱载坖点点头，这正是朱载坖想说的，自从通贡互市以来，大明和土默特每年通过互市，获益颇丰，大明从蒙古每年可以获取一万多匹战马，而蒙古也从大明获得茶叶、铁器、瓷器、丝绸等生活必需品，对于土默特蒙古来说，他们才刚刚过上好日子，你让他们现在就和大明翻脸，再回到之前的苦日子，恐怕俺答未必愿意，即便是俺答愿意，他麾下的部众们愿意吗？
朱载坖说道：“元辅之言，甚合朕意也！北虏犬羊之性，岂可轻纵？必以威临之，方可得万世之太平也！”