且说九婴率军接应波旬，岂料帝俊伏兵十路杀出，妖魔被打了个措手不及，死伤惨重，好不容易杀出重围，漫天诸神穷追不舍。沙旦放出亿万毒蝇阻挡追兵，火神布下无边火海，亿万毒蝇在火海中化为灰烬。九婴兵败逃到下界，又被天吴率领的四海龙兵截杀，沙旦还想用亿万毒蝇开路，可是面对海皇的寒气，毒蝇根本就不敢露头。经过惨烈的激战，妖魔死伤殆尽，沙旦被海皇的翻天印打伤，眼看天兵天将赶到，妖魔将被一网打尽。幻蜃见形势危急，取出魔幻宝盒，化为城堡，众魔避于其中，总算得以逃生。帝俊此次亲征，消灭妖魔十几万，三界众生无不敬畏。诸神正要趁胜追杀，帝俊曰：“此战未见波旬，定是破坏补天去了”。遂引军回援天界。
且说女娲补天，仅有九日期限，而补天之事又是在天上进行的，这九日的时间在天界是极为短暂的。尽管时间紧迫，但是女娲无论如何，必须在极短的时间内完成这项艰巨的任务。当时瑶池圣母亲自带兵护卫，九天玄女在一旁协助。女娲经过一番劳苦，补完了三万六千块五彩石，还剩五百零一块，由于此前炼制补天石和息壤耗费了太多的灵力，而且没有得到充分的休息，此时已经感觉体力不支。九天玄女见女娲元气大伤，劝她稍作休息。女娲曰：“剩下的时间不多了，补天救世刻不容缓，千万不能半途而废”。说完，她仍然坚持不懈的努力。瑶池圣母救夫心切，对这位人间的皇后充满无限感激。
且说补天之石越来越少，女娲发现了一块废石，于是随手丢弃下界，又换了一块。正要补时，忽有一条千丈巨蟒冲破云霄，直奔女娲扑来。女娲大惊，手中的五彩石脱手而下，坠落人间。九天玄女、瑶池圣母赶紧拔剑，一左一右守护在女娲身旁。那巨蟒化为人形，正是修蛇，叫道：“云里牺，你的死期到了”。瑶池圣母喝道：“你是何方妖孽，竟敢到此撒野？”修蛇大笑道：“我是魔界的邪后，修蛇是也，专为阻止你们补天而来”。瑶池圣母大怒，回顾身后道：“青鸾，杀了这妖女”。青鸾拔剑直取修蛇，修蛇持剑相迎，双方杀在一处。那青鸾是凤王之女，神通广大，修蛇此番可谓遇到了劲敌。妖蛇与神鸟之争，并未影响女娲补天的决心，只见她聚精会神，继续争分夺秒。
正当此时，只见一阵乌云滚滚而来，原来是波旬率众赶到，身后四大元帅依次排开，分别为泼稚、罗侯、佉罗骞陀、毗摩质多，五百魔神杀气腾腾。直到此时，女娲仍然不为所动，只顾补天。波旬大笑道：“云里牺，我劝你还是省点力气吧”。女娲并未因此分心，对波旬的话置之不理。波旬大怒，喝道：“云里牺，你给我住手”。瑶池圣母大惊，喝道：“泼魔，休得无礼，此处是天界，容不得你们撒野”。波旬冷笑道：“天地将重归混沌，你们这些高高在上的神仙，好日子也快要到头了”。顿时群魔乱舞，齐声欢呼。
且说瑶池圣母闻听此言，问道：“好大的口气，你是谁？”罗侯告曰：“此乃魔界的邪帝，波旬是也”。在场的天兵天将，闻听波旬之名，无不惊恐满面。波旬一声令下，五百魔神一拥而上，瑶池圣母率众迎战。天兵天将本来就不多，如何挡的住神通广大的五百魔神。九天玄女劝女娲暂避一时，女娲早将生死置之度外，依旧面不改色的取石补天。波旬叫道：“给我杀了云里牺”。数十个魔神直奔女娲杀来，眼看女娲危在旦夕，正好天河水师赶到，为首二将正是保江、钦皋，把妖魔层层包围。保江叫道：“大胆妖孽，竟敢阻止女娲娘娘补天，乃自取灭亡”。波旬大笑曰：“我这五百魔神个个神勇，何惧你们这些乌合之众？”保江、钦皋大怒，率军围杀群魔。五百魔神果然名不虚传，天河水师虽然人多势众，仍然挡不住魔神的攻势，被杀的落花流水。
且说瑶池圣母见情势危急，赶紧去向三清教主求救。激战不久，天河水师伤亡过半。女娲仍然专心补天，九天玄女劝道：“事急矣，再不逃就来不及了”。女娲泣曰：“我若一走，前功尽弃”。执意不从，在喊杀声中坚持补天。九天玄女还想再劝，忽见十几个魔神突破天河水师的阻拦，直奔女娲杀来。九天玄女顾不了许多，急忙拔剑迎了上去。天河一带刀光剑影，喊杀声惊动了天庭诸神，天后令瑞吉率众救援。波旬眼看补天之石不多，天河的缺口即将复合，急令四大元帅齐上，直奔女娲杀来。女娲全心全意投入到了补天之事，对杀气腾腾的四大元帅视而不见。四大元帅正要动手，刚好瑞吉率众赶到，大叫：“住手”。波旬问道：“你又是谁？”瑞吉曰：“吾乃消灾真君，瑞吉是也”。波旬嘲笑道：“无名毛神，就凭你也敢到此送死，真是自不量力”。瑞吉大怒，率众一并杀向波旬，却被四大元帅所阻，杀的难解难分。
且说太上老君因天人五衰的缘故，险些丧命，多亏元始天尊、灵宝天尊合力救治，总算保住了性命。人间由于洪水造成的灾难，人类百不存一，众多的水鬼不得超生，急需超度。太上老君劝道：“我现在已经脱离了危险，二位教主，你们超渡众生要紧”。元始天尊曰：“既然如此，你要好好的休养，以便早日恢复元气”。太上老君叹道：“只恨我有心无力，不能与你们共同超度众生”。正说之际，瑶池圣母来到玉清境，向三清教主告急。元始天尊问道：“婉妗，何事如此惊慌？”瑶池圣母告曰：“三位天尊，祸事了，波旬率领五名百神通广大的魔神，杀上天界来了，他们要阻止女娲补天”。灵宝道君曰：“波旬竟然如此猖狂，此乃开天辟地以来，前所未有之事”。太上教主曰：“此魔趁劫数而来，企图阻止女娲补天，好让天地重归混沌”。
瑶池圣母告曰：“如今天帝亲征邪魔，天庭的兵力多在下界，所以给了波旬可趁之机”。太上老君曰：“你们在此普渡众生，我去对付波旬”。灵宝天尊曰：“你刚刚经受过天人五衰，能够挺过来已经是奇迹了，千万不能轻举妄动，还是我去对付波旬吧”。元始天尊曰：“此魔是我的老对手了，还是我去会会他吧”。商量已定，于是灵宝天尊留下超渡众生，太上道祖留下安心休养，元始天尊前去迎战波旬。波旬见四大元帅被瑞吉所部拦阻，便亲自去杀女娲。忽见金光万道，交织在一处，化为元始天尊，叫道：“住手”。波旬大惊道：“元始天尊，你退位已久，没想到如今连你都出面了”。元始天尊曰：“自从开天辟地以来，我们好久不见了，如今你来了，我当然要出面了”。波旬怒道：“你们这些高高在上的天神，把我们魔族逼的走投无路，可曾想过会有今日？”