驻东印度殖民地的最后一艘巡洋舰被中国海军击沉，至此，荷兰已完全失去在东印度群岛的制海权。
巴达维亚战役结束当晚，中国外务部召开特别会议，宣布支持苏门达腊独立主张，中国海军将协助当地民团继续作战，直到荷兰接受苏门达腊独立现实，同时，外务总长唐绍仪也对记者表示，此次南洋战争中，中国、日本各自单独作战，并非联合作战，因此，从法律上讲，中国与日本并未正式结成军事同盟，中国将在欧洲战争中继续保持中立立场。
4月28日，巴达维亚陷落的消息得到证实，荷兰国内一片恐慌，金融发生剧烈动荡。由于关于荷兰政府即将参加对德战争的谣言四起，荷兰国内食品与燃料价格猛涨，并最终引发国民抗议，荷兰首相不得不发表公开讲话，宣布荷兰将继续在协约国与同盟国的战争中保持中立，以此稳定人心，作为对荷兰政府表态的反应，英国政府和法国政府在荷兰首相发表公开讲话当天即宣布停止对南洋战争的调停努力，并在中荷、日荷战争中保持中立。
4月29日，走投无路的荷兰政府向美国政府寻求帮助，经过两日磋商，美国政府在犹豫之后，终于在5月1日宣布接受荷兰政府的托管请求，从当天起，美国菲律宾殖民当局将从荷兰东印度殖民当局手中接管婆罗洲的一切事务，并宣布，从5月1日起，直至战争结束，婆罗洲地区为“局外中立地区”，任何交战国的武装力量和准军事组织都不得在这一地区实施敌对军事行动，否则，美国军方将采取必要措施维护婆罗洲地区的和平与稳定。
5月1日下午，美国政府通过外交机构分别向中国、日本政府递交了相关外交文件。就婆罗洲地区在南洋战争中的地位问题与两国政府进行了交涉，当天晚上，中国中枢政府宣布接受美国方面建议，不对婆罗洲地区实施军事行动，次日下午，日本政府也宣布接受美方立场，不对婆罗洲用兵。
5月2日，中国海军南洋分舰队炮击了爪哇岛东部重镇泗水，并掩护苏门达腊民团实施登陆作战，于当天控制泗水，至此。荷兰在爪哇岛的殖民统治土崩瓦解。同日，中国陆军局部动员，首批陆军部队由广州登船，前往海南岛。
同一日，日本海军舰队进攻马鲁古群岛，并出动飞机轰炸了岛上荷军兵营。
面对中日两国军队的夹攻，荷兰东印度殖民当局已完全无法控制当地局势，婆罗洲、马鲁古、锡里伯斯、安汶等地区陆续爆发土著民暴动，荷兰对东印度群岛的殖民统治已呈土崩瓦解之势，东印度群岛的动荡局面进一步波及到了整个东南亚地区，马来亚、菲律宾、法属印支殖民地、英属缅甸殖民地均发生了反殖民暴动，虽然很快被殖民军镇压下去，但是“亚洲独立”的呼喊正随着南洋战火的熊熊燃烧而高涨，受此形势影响，在欧洲西线与德国军队作战的印度军队中出现“印度独立”的呼声，并影响到了军队士气，随后不久，由于法国军队中厌战情绪蔓延并进而导致兵变，协约国西线攻势大减，德国军队趁机反攻，西线战局一度岌岌可危，英国远征军甚至已制订了协助法国军队保卫巴黎的巷战作战方案。
南洋战争牵动欧洲西线战局，欧洲西线战局牵动英国、法国政局，在岌岌可危的形势下，英国、法国只得继续向荷兰政府施加外交压力，迫使荷兰政府尽快接受现实，接受中国、日本政府提出的和平条件，以期尽快结束东南亚的动荡局势。
5月6日，荷兰王国政府宣布接受英国、法国、美国、俄国调停建议，单方面宣布在东印度群岛战区实现停火。同一日，暹罗泰国政府向荷兰政府递交外交备忘录，要求荷兰东印度殖民当局加强对当地暹罗侨民的保护力度，不然，暹罗政府将“采取必要措施保护本国侨民”，与此同时，暹罗海军的两艘驱逐舰出现在婆罗洲近海，不过很快就被美国军舰驱逐。
5月7日。中国宣布接受荷兰停火倡议，在苏门达腊、爪哇战区实现停火，次日，日本也宣布接受荷兰停火倡议，在已占领地区实现停火。
5月9日，中国、日本、荷兰三国代表在瑞士日内瓦举行正式会晤，讨论结束南洋战争事宜。
同一日，暹罗泰国发生政变，政府倒台，亲德派政府官员被关押进兵营，英国、法国殖民军队随即宣布“应邀”进驻暹罗首都，帮助维持局面，当天，暹罗政府即宣布加入协约国集团，参加对德战争，次日，中国、日本政府分别发表政府公报，宣布不承认暹罗新政府之合法性，要求政变者立即释放被囚禁的政府官员，与此同时，两国也宣布，暂时停止日内瓦会谈，恢复在南洋战区的“自由行动”，受此要挟，英国、法国政府只能“建议”暹罗新政府释放被关押的旧政府官员，随后，在英国军队的保护下，这些人前往中国、日本使馆，并最终前往香港。
5月11日，美国海军派遣陆战队登陆婆罗洲，以武力保证这一地区的中立，并在荷兰殖民军前往镇压土著民暴动时维持沿海补给站的秩序。
5月15日，荷兰政府宣布完全接受中国、日本的和平条件，同意由远东和平委员会决定苏门达腊、爪哇、马鲁古、新几内亚、锡里伯斯等地区未来的政治地位，作为交换，中国、日本也“在原则上”承认荷兰对婆罗洲等地区的“实际控制权”。
同一日晚些时候，中国、日本、荷兰三国代表与英国、法国等中立国代表正式在瑞士日内瓦签署和平协议，宣布结束南洋地区的战争状态。
至此，南洋战争结束，相比在欧洲进行的那场漫长的战争，这场南洋战争确实是一场“快速战争”。
远东地区终于平静下来，欧洲各国长嘘口气，然后，又全神贯注的投入到那场据说可以终结一切战争的欧洲战争中去了。
第一卷 时代先锋 第902章 战争之后
第902章 战争之后