堡击敌，又派副将军石云倬等将官赶赴南山口、梯子泉一带设伏，断敌退路。准噶尔部七千人马攻打哈密时专事焚烧粮草，抢夺驼马辎重，虽被曹让部击退，但也造成重大损失。
派往断敌退路的石云倬竟迟一日发兵，当该部到达指定位置时，准噶尔军已离开设伏地点，准噶尔军休息时的点火灰烬还有余热。但石云倬没有挥师追击，致使叛军劫持大量物资安然撤退。雍正帝降旨，治石云倬、曹让斩首示军。严责岳钟琪“攻敌不速，用人不当”。
岳钟琪接连受雍正帝的严责，显然已经失宠。军机大臣、内阁大学士鄂尔泰乘机奏本，极力弹劾岳钟琪。雍正批准了鄂尔泰的弹劾，下谕“交部议决”。结果削去了岳钟琪三等公爵和太子太保封衔，降为三等侯，仍护大将军印。
时隔不久，雍正帝又下旨诏岳钟琪离疆返京“商办军务”，由副将军张广泗护宁远大将军印。十月，岳钟琪怀着忐忑不安的心情，一路风尘赶到京城，张广泗弹劾他的奏折也随之到了雍正帝的龙案。在张广泗和鄂尔泰合力弹劾下，当月雍正就下诏将岳钟琪“交兵部拘禁候议”。岳钟琪被捕入狱以后，在等候兵部的判决，一直等了整整两年，
雍正十二年1734年十月兵部的判决才下来，判决居然是“斩决”。雍正帝接到兵部议奏折子，左右权衡，最后，念及其当年进西藏、平青海之功，改“斩决”为“斩监侯”，并处罚银七十万两。
乾隆二年1737年，岳钟琪和傅尔丹同被释放，贬为庶人，回成都。岳钟琪在成都郊外百花潭浣花溪畔结庐居住。他取名“姜园”。
平日里，他一身布衣木履，粗茶淡饭；清晨早起，在爱闲亭中打几路拳脚，舞几套刀剑，然后牵着他心爱的战马，沿着浣花溪畔溜达；茶余饭后，喂一喂鸡鸭家禽，或者走出姜园，漫步于乡间田埂，或聚集老农于树下闲话桑麻。晚来掌灯，他这才伏于几案，或挥毫吟写田园诗；或秉烛夜读楞严佛经。
岳钟琪对佛家教义也渐渐青睐，常常入寺拜佛听法。一天岳钟琪回到金堂县老家，在城南十五里的龙尾寺拜佛，盘桓晚了，便留宿寺中，于是写下了夜宿龙尾寺。
乾隆十三年1748年三月，由于大金川叛乱而清廷出兵多时未果，乾隆帝想到岳钟琪，决意重召，先授予他总兵之衔，后改授四川提督，赐孔雀花翎，其时岳钟琪已届六十二岁，久违gun g十年有多了。
岳钟琪来到金川军营，张广泗即命岳钟琪领四路官兵，驻扎党坝。岳钟琪抵达前沿军营，登上山梁观察地形，只见这党坝三面环敌，而敌寨处处明碉暗堡，所据地势十分险要，碉寨之间又成犄角之势，相互照应，进可攻，退可守。而党坝清营，简直就是叛军桌上的烤肉。
岳钟琪经过反复思考，向张广泗提出“从党坝就近直接攻打康八达，先拿下勒乌围门户，直逼叛军老巢”的计谋。张广泗反而命令岳钟琪到百余里外去攻打无关紧要的昔岭、卡撒两寨。岳钟琪反对，幸好监军讷亲也赞称岳钟琪的意见。张广泗最后来一个“等我再想一想”，从此按兵不动。
对于张广泗舍近求远，避重就轻的战术，岳钟琪产生了极大的怀疑。岳钟琪在军中进行了一番调查，发现自张广泗率军抵达金川后用了两位幕客，一位是他的旧友云南昆明人王秋，另一位是当地土官良尔吉，这二人都是莎罗奔派来的奸细，所以两年来清军的行动莎罗奔都早已知道，预先防范。
岳钟琪急将此事密奏乾隆。乾隆看罢甚是愤怒。立即下旨，“着岳钟琪就地诛杀奸细，接管金川军事；罢去张广泗军权官职，逮京侯审。”岳钟琪重掌川军大印后，速斩两个奸细，接着迅速组织征剿。秘密调集人马三万五千，留三千兵力守护粮草辎重，三千兵力分布于党坝、泸河一线，以一万兵马暗出党坝，偷渡泸河，水陆并进，突然袭取敌寨跟杂；再以一万人马自甲索进马牙冈、乃当两地，与出党坝的一万人马形成东西两翼并进之势，包围了马牙冈、乃当两敌寨。
经过一番激战，攻克敌大小碉卡四十七处，缴获粮谷十二仓，收复田亩一千四百余段，焚毁敌寨数十座，斩获土兵无算。清军旗开得胜，士气大振。岳钟琪乘势攻击最顽固的堡垒康八达。康八达是莎罗奔老巢勒乌围的门户，工事坚固，重兵把守，屡次进攻，毫发未损。岳钟琪心生一计“引蛇出洞”。
他派兵在康八达敌碉寨不远处运土夯堡，并派出数队官兵用口袋装土，假装押运粮草。造成清军久围康八达，并且有大量存粮的假象。每天入夜，清军大队人马各持huo yào喷筒，鸟枪弓箭，埋伏在土堡四周，单等敌兵出寨抢粮。几天后的一个晚上，康八达守敌果然出寨，大队人马直扑清军粮草辎重。待敌人全部进入埋击圈后，只听一声号炮，清军伏兵四起，枪筒弓箭齐发，火星飞溅，散弹呼啸，敌兵纷纷中弹落马。侥幸逃出的拼命往往碉寨里跑，斜刺里又有一队清兵杀出，直冲寨门，与敌兵搅和着一起进了康八达寨内，很快控制了寨门，攻占了制高点，后续人马掩杀入寨。康八达攻下来了，莎罗奔老巢勒乌围已是一座孤城。
新扎下的清军大营与勒乌围隔泸河相望。当莎罗奔得得知清军统帅是岳钟琪时，心中一喜一忧。喜的是莎罗奔与岳钟琪有过一段交往，莎罗奔及本部族上下都视岳钟琪为大恩人。康熙六十一年，莎罗奔带领本族士兵随岳钟琪作战，战后经岳钟琪一力推举，朝廷授莎罗奔金川按抚司一职。
再有就是岳钟琪调停杂谷、金川、美同、沃日、龙堡部落间的内乱。岳钟琪秉公而断，把他们失去的土地山寨调回了他们。所以族人对岳钟琪敬佩有加，视为“恩公”。忧的是自己与朝廷对抗数年，已是朝廷死敌，以岳公的忠心和谋略这仗肯定是必败无疑。莎罗奔决定请求罢兵归顺朝廷。
岳钟琪提出要亲自过河到勒乌围一趟，以查探莎罗奔的实虚。众将领都劝应多带些人马才安全。岳钟琪却说：如果此去多带人马会引起莎罗奔的怀疑，不利招降。次日，岳钟琪只着官服，只带随从十三骑，渡过泸河闯入虎狼之穴。众土司见来人真是岳公，不禁惊喜过望：“果然岳公啊”齐刷刷跪伏于地，不停地叩头请罪。
莎罗奔见到恩公，喜出望外，他从地上爬起来，亲自为岳钟琪引路，恭敬地迎入自己的寨堡，请岳公入坐首席，由土司侍候左右，献上奶茶。岳钟琪按藏族习俗，敬天敬地敬主人，然后一饮而尽，接着又要来一碗，一气喝干。莎罗奔等见岳公如此看得起藏胞，个个感动得泣不成声，长跪不起。
莎罗奔又邀岳公当夜住宿勒乌围寨堡，以叙旧情。岳钟琪概然答应。勒乌围上下欢天喜地，宰牛杀羊，款待岳钟琪。当晚席散，岳钟琪宽衣酣睡，全无防备之意，更得莎罗奔等众土司的敬佩。
次日，莎罗奔、郎卡及众土司随岳钟琪渡河来到清军大营，正式举行了乞降归顺仪式。大小金川之乱，在祥和的气氛中打上圆满的句号。
乾隆十五年 1750年，西藏珠尔墨特为乱，时年64岁的岳钟琪，奉命再出康定，会同总督策楞，捕获卓呢罗布藏紥什等，叛乱平息。
乾隆十八年1753年，岳钟琪的长子岳濬病逝，岳钟琪心如刀绞，痛不欲生。自己年岁已高，痨肺病也日重一日。