键的问题解决了，余下的问题就好办了：护国军提供布匹、药物等物资让革命军补给，并派出医疗小队给革命军伤员治疗。革命军可以在贵州境内的指定地点休整半个月，半个月后必须出境。革命军在休整期间要遵守民族复兴党政府的政策条令，不许在贵州境内开展活动宣传，不准征兵。立即释放被护国军扣押的革命军战士，作为补偿，护国军在革命军离境后，除开归还革命军全部弹药外，补给部分美式枪械弹药给革命军。
由于在最棘手的缴械问题上取得了突破，双方都同意了过境条款，护国军和革命军很快就签了协议。
协议签字后立即生效。革命军开拔到凤冈军营休整。而对于护国军遭受的三面围攻，伍墨涵、肖思凯居然一致认为护国军会打赢。
在妥善解决了革命军过境问题后，方云算是松了一口气。四个麻烦解决了一个，对湘军的第27旅，他给辅2师师长江涛下了指示，要务必全歼，要把何康打痛。命令司令部直属坦克营配合行动。同时，命令林红军的禁卫队做好黔东的防御，坚决把跟在红军后面的那五万帝国军队堵在贵州境外；命令张连武的第30师欠一团北上蒙渡一线迎敌；命令第30师第2团、第一野战炮兵团105重炮营乘汽车前往土城。
现在就剩下问题最大的桂系第九旅了。贵州山山沟沟多，要藏支部队还真容易，唯有命令各地民团部队要注意敌情。就桂系第七旅的攻击目标来看，必是贵阳无疑，那么第九旅的目标也应该是贵阳。
川军暂3旅乙级向赤水地区发起了攻击。当年革命军在此地区与川军爆发过激战，结果是革命军退走威信。禁卫队黔北分区两中队共1500人汇合预备役两个整训团投入了战斗。禁卫队采取分段防御，诱敌深入的策略，在元厚、旺隆场设下伏击圈，充分发挥武器优势，歼灭其一部，将暂3旅紧紧围在赤水河两岸。随后第30师第2团和炮兵营投入战斗，用105火炮轰击赤水河两岸的敌军，激战两天一夜，几乎将暂3旅全歼，毙敌两千多人，俘虏5000多人，取得对川军首战告捷。
川军教导师猛攻石门坎一天，遭护国军坚守反击，有所损失。次日再攻，被增援而来的第一野战炮兵团155重炮营轰击，损失惨重。教导师独立旅向石门坎攻击了三次，均被击退，死伤近两千人。这时，传来暂3旅在赤水河被全歼，川军士气大落，退回三江、苏家湾。
川军领略到黔军的威力，惶恐。
革命军第二、六军团越过湘黔边界后，就消失得无影无踪，让跟随在后面追击的约5万湘军和中央军部队感到疑惑。随即，湘黔边界的护国军坚决拒绝帝国追剿部队入境，让在长沙的陈军抓到了口实。他指责护国军总司令方云和社会党革命军有勾结，是帝国的叛徒。这一指责，在国内引起轰动。
帝国政府首脑李飞耘督促民族复兴党政府对贵州境内的革命军进行围剿，同时要求方云开放边界，让追剿部队进入贵州剿匪。而昆明的美英法领事馆迫于大汉帝国总使馆的压力，也向民族复兴党政府提交了照会，希望护国军对境内社会党革命军采取措施，否则，复兴党政府与他们之间的商贸活动将受到一定的影响，并以照会的方式通知了方云。
三国撤走了在护国军的军事教官人员和家属，并单方面中止了同方云的物资交易。
对美法英这三国领事馆落井下石的做法，方云感到愤怒。特别是对法国扣押他在海防港的物资，更是深恶痛绝。
面对危局，护国军总司令方云对此进行了驳斥，他对外宣布社会党革命军是进入了贵州，但不是在护国军的允许下进入的。贵州山多洞多，地势复杂，而革命军又善于运动，以护国军的实力很难找到并消灭他们。反而，桂系、湘军、川军趁革命军窜入贵州之际，对贵州大举进攻，才是狼子野心，也使得护国军抽不出力量去对付和寻找革命军。湘军、桂系、川军才是帮革命军的真凶等等之类，最后要求帝国政府严惩桂系、湘军和川军，并要求他们赔偿因战争给复兴党政府带来的损失。并坚决地拒绝了李飞耘要求开放边界，让追剿大军进入贵州的要求。
方云的言论一发表，国内又是一轮轰动。有不少有识之士都在斥责桂系、湘军、川军和护国军置民族危难于不顾，大打内战。于是，民族复兴党政府再次发表声明，护国军是坚决抗日的，但是桂系、湘军和川军已经把战火烧到自己的领地，护国军不得不进行反击。此后，湘军，桂系和川军的媒体也出来攻击护国军，说护国军通匪等等。随后，四方新闻媒体展开了前所未有的新闻大战，手段之卑鄙，行为之恶劣让人瞪目结舌。
李飞耘自然是勃然大怒，认为方云是故意在庇护革命军，再三电令方云对境内革命军采取措施，开放边界，否则后果自负。
方云在贵阳也是针锋相对，指责李飞耘袒护川军、湘军和桂系军阀，为达到吞没贵州、云南两省的目的，以莫须有的罪名指责护国军是不负责任的行为，有失一个帝国总统的威严。
就在双方口水战打得难分难解之时，江涛的辅2师在坦克的配合下，于清溪――新店坪沿线全歼湘军第27旅甲级，俘虏近四千人，缴获湘军大批粮食物资。这样的战果令人吃惊，特别是护国军居然有坦克部队，这让李飞耘本人也吃惊不小。与方云论战的语气也降了许多。但是，更让帝国媒体吃惊的事情还在后面。
按原来的计划，攻占大凉山地区重镇西昌的战斗，应该是在第一阶段作战计划完成后进行的。但是，计划跟不上形势的变化，川军和湘军败退得太快，三路进攻的敌军只剩下桂系一路，所以参谋总部决定提前攻打西昌。
炮兵司令部司令廖耀湘将军被任命为西昌战役的前敌总指挥。率领护国军在云南的第13师北上攻击大凉山重镇西昌。西昌驻军当年和革命军也爆发过激战，依靠坚固高大的城墙，让华泽民领导的革命军中央纵队连续两次攻打都未成功。廖耀湘集中了120门大口径迫击炮和平射炮，集中轰击西昌城城墙一段。猛烈地炮火连续轰击了两个小时，就轰塌了一截城墙。城内川军魂飞魄散，集体开城投降。
这样廖耀湘只凭炮火就攻下了西昌，部队毫无伤亡。占领了西昌后，廖耀湘展开部队，仅用5天时间，就控制了整个大凉山地区，第13师甲级强悍的山地丛林作战能力，令川军闻风丧胆。