国大事应该在金銮殿上商议，可此时京城以北已全是辽东的天下。北京城中的大明朝根本就是辽东的传声筒而已，吴三桂等辽东将领都是军人出身，无人受得了那班大明朽臣在朝堂上的推诿扯皮，那只能是白白耽误时间罢了。而且这些大明朽臣竟还有一个奇怪的习惯，他们竟以能被在金銮殿上被皇帝杖毙为荣，所以一旦升朝，这些大明朽臣谏起言来，当真是不知死为何物。一次早朝，有大臣提出皇宫因遭大顺贼军蹂躏，应尽快修茸，以显大明皇帝之权威，可粗略算下来，仅仅是修茸皇宫、增添应有器物、召齐宫中太监宫女几件事下来，便得费银五百万两。如今南方大顺军尚未平息，南京一些大明旧臣也未上降表，京中百姓尚处于饥寒交迫之际，如真有银两或是用于军中，或是赈济百姓岂不更胜于维修这个只有小皇帝一人居住地皇城可就是修茸皇宫这件小事，竟接连有三四位言官在大殿上跪气。小皇帝朱慈炯年纪尚小，朝中大小事务全是吴三桂一人说得算。而这些言官也全是由吴三桂在年轻的大明臣子中一手提拔上来，本来只是让他们在朝堂上充充场面，可谁曾想他们竟真拿自己当回事了。吴三桂开始还耐着性子对他们好言相劝，可没想到越劝这些人却越来劲了，跪气之人竟是越来越多，最后除却新升的辽东将领外，其余大明旧臣中竟有一半要求尽快修茸皇宫。
吴三桂这时真的生气了，一怒之下，将为首的三名言官拉下去杖责三十，没想到这三人被杖责后，竟拖着重伤之身，死不肯下殿休养，一身鲜血的赖在宫门前哭天喊地，指责吴三桂的不是。吴三桂见这些人如此不知好歹，盛怒之下，命人将他三人拉回来，就在宫门前将其杖毙。十几杖下去，本就重伤的三名言官已气绝身亡，吴三桂以为这次总该消停了吧，可朝中剩余的大明旧臣见三人被杖毙后，虽有些人退了回去，却依旧有十余人跪倒在金銮殿上，苦苦哀求吴三桂。吴三桂当时地脸色可以说是复杂之极，一会儿血红，一会儿铁青，一会儿苍白，最后指着这些谏臣咬牙道：“好、好、好，你们不就是想在史书上留个姓名吗我成全你们来人，将这些死谏之人都给我拉下去，杖毙”这一天共计有十四名言官大臣在宫前被杖毙，可这些人的鲜血竟未能叫其他人引以为戒，反而依旧不断有明臣在朝堂之上死谏，只求速死。吴三桂对这些所谓的忠臣十分清楚，他们决非是真为了大明朝着想，不然也不会在当初大顺军入京时苟且偷生，这些读书已经读得傻了的人也知道当时就是死了，也是白死，一旦大顺得势，在史书上也只会说他们是一班愚臣，为大明愚忠，可现在却是不同了，如今这天下依旧是大明朝的天下，自己因谏言而被杖毙在宫门外，史官便得给自己在大明史上记上重重的一笔，自己便可以流芳百世。以吴三桂的性格当然不会饶过这些人，凡是死谏的，全部满足了他们，不过几次之后，吴三桂便已厌烦了，如今在金銮殿上根本无法商议国事，一件小事这些人都能争上几日之久，只是白白浪费了时间。
所以此次得知南京众明臣竟然胆敢自立，吴三桂只是在宫外自己的摄政王府中召集了辽东相关将领商议此事，却并不惊动那般大明朽臣。如今距辽东大军入关已是一月有余，而辽东现在各处都是平安无事，所以除了在南蒙、西蒙留下必要的边防军，辽东军大部分将领都已赶至北京城，以应对今后的战事。众将围坐室中，吴三桂将南明新皇登基的诏书让众人传阅一圈后，才道：“如今南明自立，咱们原本的打算已经落空，看来这仗是不打不行了，大家都说说，这仗该怎么打”
坐在堂中的辽东众将看过南明的诏书后，七嘴八舌的议论起来，有人认为应该先将大顺军彻底消灭，以除后患之忧，再集结辽东优势兵力，与南明决一死战，定要将那些南明的那些遗老遗少一网打尽。也有人认为李自成和他的大顺军现在已经是穷图末路，无法再与辽东争锋，反而是南明却一直未曾参战，现在在江南屯兵达几十万之多。而且江南历代便是大明经济中心，银粮富足，正是辽东的心腹大患，应趁其建国不久，江南各地百姓对其尚未归心之际发兵征讨。众人议论了大毕日，吴三桂见众将商议的也差不多了，轻咳了一声，众将闻声后全都正襟危坐，等吴三桂开口。吴三桂这才道：“眼下南明自立。固然是对咱们一统中国十分不利，可他们实力有限。虽说有几十万大军，但江南军卒向来不是北方军的对手，反倒是咱们，正可趁此时机将南明的那班旧明朽臣一一清除，为咱们将来在中国实施新政打下基础。再说李自成那班贼寇更是不堪，据探马回报，李自成此时正坐阵太原，派出几路大军赶赴大同、固关以防咱们入侵山西，可就凭他现在地那点兵力那里防得住咱们。咱们正可驱赶着李自成一路向南逃窜。让他与南明火拼，咱们才好坐收渔翁之利。”众将听后，都是深以为然，辽东军的实力摆在那里，那里是大顺和南明所能抗衡的，对吴三桂的驱狼吞虎之计也十分赞成。
吴三桂坐在堂上高声道：“众将听令”
下面众将齐声应道：“在”“吴智，你马上起草征敌诏书，他南明此时再立新皇本就是名不正言不顺，南方各省定会有许多人想要投靠咱们。你定要作好接洽工作，等咱们与南明交手时，这些人便是最好的内应。吴襄、祖泽远，你二人率骑兵一团、二团赶往大同，取下大同后，一路北下。许立、许有利、祖大寿、何可刚随我一同赶赴固关一带，咱们就来会会这大顺的精锐，咱们两军在太原会合。再图陕西。同时命驻守台湾岛的吴三辅、吴安、吴本三个步兵团及水军各团作好在南方登陆的准备，一旦大顺军逃入河南，与南明交上手，待他们两败俱伤时。咱们从南北同时进攻，争取尽快结束这场大明内乱”
吴三桂准备挥兵南下，而南明却是内乱不已。自崇祯帝殉国的噩耗传到了江南，明致任大吏如江督吕大器、御史史可法、总督马士英、总兵黄得功、副总兵高杰、进士黄淳耀、巡抚祁渊、大学士高宏图、都给谏刘宗周一班故臣，都齐集魏国公徐宏基府第，共谋继立。马士英和诚意伯刘孔昭，以福王朱由崧是光宗帝嫡侄，伦序当立。史可法力争，谓不应乱立福王，应寻到万岁朱由检亲子立其为帝才是名正言顺，可众故臣不听，都急着想要成为新皇登基地功臣，他们那里有时间去寻早已不知所踪的太子。可就在他们未立新皇之时，突听到辽东吴三桂竟先寻到了朱由检亲子朱慈炯，并在北京城为其举行了登基仪式。此消息一传到南京，众大明故吏顿时分为两派，一派以进士黄淳耀、都给谏刘宗周为首，认为朱慈炯登基名正言顺，自己这方应尽快响应，挥军北上，与辽东军南北夹击之下，平定大顺贼军，还大明一个朗朗乾坤。可以马士英等人为首地一派却依旧要在南京立福王为帝，而最令人想不到的却是史可法，他本来是反对立福王为帝最坚决的人，可当他听说吴三桂已寻到朱慈炯，立其为帝后，竟一反常态，转头支持马士英等人。
说起来，史可法之所以会有如此变化，却是受他的先师袁崇焕所托。当年史可法年青时进京赶考，半路上行囊却被强人掠走，孤身一人饥寒交迫，夜宿在一间破庙之中。正巧当时已出仕的袁崇焕回京述职，途经破庙，见其可怜，便邀其一同上路。一路上见史可法言谈举止都颇有大家风范，十分赞赏，待到了京城时，两人已是师徒相称。后来史可法在袁崇焕的资助下，才能顺利参加当年科考。为官后史可法更是袁崇焕相交莫逆。不过很快袁崇焕便主动请缨，远赴关外，驻守宁远，而刚为进士的史可法当时却尚未为官，两人只能就此分别。待到袁崇焕遇难时，史可法也不过只是一小吏而已，根本无法营救袁崇焕。在当时，大明朝中众臣都对袁崇焕避之不及，生怕被其牵涉其中，唯有史可法念及当年大恩，不但主动进京，并变卖家产，只为见恩师一面。两人在狱中相见时，不胜唏嘘，感叹这些年的际遇。史可法知道自己人言势微，无法改变袁崇焕之命运，两人狱中抱头痛哭一番后，史可法问袁崇焕可有何遗愿，他史可法宁可豁出一条性命，也定要为其完成。